Теория эффективности социально-экономического развития в динамике взаимодействия технологических укладов и общественных институтов. Руководитель: Глазьев Сергей Юрьевич – доктор экономических наук, профессор, академик РАН, советник Президента РФ, заведующий кафедрой экономической политики и экономических измерений ГУУ.

Управление персоналом. Руководитель: Митрофанова Елена Александровна – доктор экономических наук, профессор, профессор кафедры управления персоналом ГУУ, лауреат премии правительства РФ в области образования, почетный работник высшего образования России.

Государственное управление и политика. Руководитель: Омельченко Николай Алексеевич – доктор исторических наук, профессор, лауреат премии Правительства РФ в области образования, почетный работник высшего профессионального образования РФ, заведующий кафедрой государственного управления и политических технологий ГУУ.

Управление реальной экономикой. Руководитель: Афанасьев Валентин Яковлевич – доктор экономических наук, профессор, лауреат премии Правительства РФ в области образования, заслуженный работник высшей школы РФ, заведующий кафедрой экономики и управления в топливно-энергетическом комплексе ГУУ.

Анагенез управления финансами реального сектора экономики. Руководитель: Жилкина Анна Николаевна – доктор экономических наук, профессор, заведующий кафедрой финансов и кредита ГУУ.

Трансдисциплинарная методология в экономических исследованиях. Руководитель: Мокий Михаил Стефанович – доктор экономических наук, профессор, заведующий кафедрой экономической теории ГУУ.

Управление маркетингом. Руководитель: Азоев Геннадий Лазаревич – доктор экономических наук, профессор, лауреат премии Правительства РФ, почетный работник высшего образования РФ, директор Института маркетинга, заведующий кафедрой маркетинга ГУУ.

Управление рисками и обеспечением безопасности социально-экономических и общественно-политических систем. Руководитель: Вишняков Яков Дмитриевич – доктор технических наук, профессор, заслуженный деятель науки РФ, заведующий кафедрой управления природопользованием и экологической безопасностью ГУУ.

Логистика. Руководитель: Аникин Борис Александрович – доктор экономических наук, профессор, заведующий кафедрой логистики ГУУ.

Системная экономическая теория. Руководитель: Клейнер Георгий Борисович, член-корреспондент РАН, доктор экономических наук, профессор, заведующий кафедрой институциональной экономики ГУУ.

Эволюционная экономическая теория. Руководитель: Маевский Владимир Иванович, академик РАН, доктор экономических наук, профессор, профессор кафедры институциональной экономики ГУУ.